Sous les planches d'un manoir tentaculaire situé dans un jardin magique et envahi par la végétation dans la banlieue de Tokyo, Arrietty, 14 ans, vit avec ses parents tout aussi petits. La maison est occupée par deux vieilles dames, qui ignorent l'existence de leurs locataires miniatures. Arrietty et sa famille vivent d'"emprunts". Tout ce qu'ils ont, ils l'empruntent ou le fabriquent à partir de ce qu'ils ont emprunté. Un morceau de sucre par-ci, un bout de tissu par-là. Mais seulement un peu à chaque fois, pour que les dames ne le remarquent pas. Les parents d'Arrietty l'ont toujours mise en garde : "Ne laisse jamais les humains te voir." Une fois vu, les petites gens doivent toujours passer à autre chose. Mais l'aventurière Arrietty n'écoute pas, et bientôt elle est découverte par Sho, un garçon humain de 12 ans qui vit dans le manoir. Les deux hommes commencent à se confier l'un à l'autre et, très vite, une amitié commence à naître...