Avance rapide de 100 ans. Ce qui reste de la population humaine survit maintenant dans une paix relative derrière des murs massifs érigés pour se défendre contre les Titans. Cette paix est brisée lorsqu'un Titan colossal, mesurant plus de 50 mètres de haut, traverse le mur et permet à une horde d'autres Titans d'entrer.
Eren Yeager s'était résigné à une vie confinée derrière ces murs. "Rien de ce que je fais ne fera de différence", pensait-il. Mais lorsqu'il rejoint l'équipe de restauration du mur extérieur mise en place pour lutter contre les Titans, il retrouve Mikasa, une amie d'enfance. Les nouvelles recrues se lancent dans une mission pour boucher le trou béant dans le mur et arrêter les vagues de titans une fois pour toutes. Avec la survie de l'humanité en jeu, y aura-t-il un avenir pour Eren et Mikasa, et pour l'humanité elle-même ?