Deux sagas classiques de la science-fiction entrent en collision : Star Trek part explorer la sombre dystopie de la Planète des singes et vous présente La Directive des primates. L'histoire suit le commandant klingon Kor qui part à la conquête de mondes humains dans d'autres dimensions. En enquêtant sur l'activité accrue des Klingons, le capitaine Kirk et l'équipage de l'U.S.S. L'Enterprise est impliquée dans un conflit qui mène à une Terre très différente, gouvernée par des singes