Lorsque Gotham City est en proie à une série de crimes étranges commis par l'équipe de méchants inspirés par les animaux, les Animilitia (composée de Silverback, Cheetah, Killer Croc et Man-Bat), Batman entre en action pour enquêter. Mais l'Animilita pourrait-elle travailler pour le puissant homme d'affaires Oswald Cobblepot alias le Pingouin ? Comment la nouvelle invention de Cobblepot, les cyber-animaux robotisés, s'intègre-t-elle dans l'ensemble ? Au final, il faudra les forces combinées de Batman, Green Arrow, Flash, Nightwing et Red Robin pour combattre ces "ANIMAL INSTINCTS".