"Pandémie" se déroule dans un futur proche, où un virus aux proportions épiques a envahi la planète. Il y a plus d'infectés que de non infectés, et l'humanité perd son emprise sur la survie. Son seul espoir est de trouver un remède et de contenir l'infection. Lauren (Rachel Nichols) est un médecin qui, après la chute de New York, vient à Los Angeles pour mener la chasse aux survivants civils non infectés. L'objectif de Lauren est simple : mener son équipe sur le terrain et sauver les survivants. Lauren et son équipe : Gunner (commandement tactique), Denise (navigation) et Wheeler (conducteur), enfilent leurs combinaisons anti-contamination, équipées de caméras afin que leurs expériences puissent être utilisées pour la recherche, et quittent le complexe. Mais rien n'aurait pu les préparer au chaos dans lequel ils sont sur le point d'entrer.