Renton, fils de scientifiques, et Eureka, une fille qui ne peut vivre sous le soleil, sont élevés ensemble dès leur plus jeune âge et s'attachent l'un à l'autre. Un jour, Eureka est emmenée. Impuissant à ce moment-là, Renton se jure de la sauver. Il entre dans l'armée et est rapidement affecté à l'unité 303 des jeunes indépendants des premières forces mobiles grâce à ses performances exceptionnelles aux côtés de son Nirvash, un système d'armure/contrôle bio-mécanique. A l'insu de Renton, se cache un complot visant à éteindre l'invasion extraterrestre en cours. Cela ne concerne pas seulement lui, mais aussi Eureka.