Bien que Fairy Tail ait été dissoute et que ses membres soient maintenant dispersés dans tout Fiore, Natsu Dragneel n'a pas renoncé à réunir la guilde que lui et d'autres appelaient autrefois leur maison. Avec ses compagnons Happy et Lucy Heartfilia, il ne reculera devant rien pour maintenir en vie Fairy Tail et son esprit fougueux, même s'ils doivent faire face à leur épreuve la plus difficile : l'invasion de Fiore par l'immense armée de l'empire Alvarez et son chef trop familier..