Nous sommes en 2005... Depuis des millénaires, les héroïques Autobots, menés par Optimus Prime (Peter Cullen), sont en guerre contre le maléfique Megatron (Frank Welker) et ses Decepticons pour le contrôle de leur planète Cybertron. Cependant, une menace encore plus grande - Unicron (Orson Welles, Citizen Kane), une planète de conversion colossale qui dévore tout sur son passage - se dirige droit vers Cybertron. Le seul espoir est la matrice de leadership des Autobots. Les Autobots parviendront-ils à se sauver et à sauver leur monde à temps ?