En 2016, la fusion d'une centrale nucléaire crée une grande catastrophe à Tokyo. 20 ans plus tard, la ville est devenue une ville fantôme en raison des niveaux élevés de radiation. De cette zone, un signal de détresse est reçu. Les forces d'autodéfense envoient trois filles de l'unité spéciale Coppelion à la recherche de survivants. Mais pourquoi ne portent-ils aucune protection contre les radiations ?